在释迦佛陀在世的时候，印度西方乌仗那圣地，有国王名恩扎菩提。有一天，他看见很多黄色的“大雁”在空中飞行，就问：“怎么有黄色的大雁？”一些熟悉佛出世史事的侍臣答道：“这不是大雁，而是释迦净饭王的太子成佛后，和他的声闻徒众前往他方，以此从虚空飞过。”国王听后，心中生起了不退转的敬信，便向佛世尊祈祷求加持。佛以神通得知，同徒众以神变力而来到王宫中，向国王说法，以此国王生起了特殊信解，向佛启请说：“我希望不舍弃俗装，也能成佛。”由于这位国王是大密根器，因此薄伽梵释迦佛布设密集曼陀罗，现起金刚持身，而为国王灌顶，开示教授，说密集本续，复由金刚手善为讲释。由此恩扎菩提王修持密集二次第诸教授，而在现生证得双运身佛果。
　　此后，恩扎菩提王便对当地的应化信众，开示金刚乘法，出了难以数计的大成就者。后来恩扎菩提王将密集灌顶，及所有教授完全传授给有承命弘扬这一法类的具缘修者鲁谟伦觉玛（义为龙女瑜伽母），瑜伽母传毗苏迦巴王。毗苏迦巴王修此法门，也获得大成就，由他传给具德萨惹哈，萨惹哈在修得成就后，将密集所有灌顶、教授完全传给怙主圣龙树，圣龙树得法后，在南方吉祥山中精修，他在此生中，获得双运身佛位成就。他将密集所有灌顶、经教、教授等完全传与上首弟子阿雅德瓦（义为圣天），及鲁衣绛秋（义为龙中菩提）、释迦协业（义为释迦友）、达瓦扎巴（义为月称）等很多得意弟子。以上阿雅德瓦等四位大师，都是修行密集二次第达到究竟，此生获得双运金刚持果位。月称论师的《密集五次第明灯疏》极受后来学者重视。此外，还出有阿阇黎桑杰交（义为佛护）等很多获得双运果位的龙树弟子。
　　从圣龙树师徒所传出的密集灌顶、经教、教授承传次第诸师，无量无边，难以数计。为一般普遍传称的灌顶师承次第，则是由圣龙树，次传阿阇黎玛当根巴，次传大成就师帝洛巴，次传班钦•那若巴，次传玛巴诺扎（即玛尔巴译师），次传楚敦•旺根多杰（义为灌顶金刚），次传昆敦•格巴根底，次传嘉贡巴•索朗仁钦（义为福宝），次传土拉瓦•楚称交（义为戒护），次传汤伯瓦•帕巴交（义为圣护），次传色顶巴•迅路峨（义为童光），次传一切智却姑峨热（义为法身光明），次传一切智帕巴峨（义为圣光），次传法王布顿仁钦珠（义为宝成布顿大师），次传穹波特巴•迅路索朗（义为童福），次传法王宗喀巴大师，次传克珠•格勒伯桑（义为福善吉祥贤），次传班钦•却季坚赞（义为法幢），次传大成就师却季多杰（义为法金刚），次传考嘉瓦•洛桑邓珠（义为善意义成，即温萨巴），次传克珠•桑杰耶喜（义为佛智），次传至尊洛桑却季坚赞（义为善慧法幢），次传金刚持师根却坚赞（义为三宝幢），次传至尊洛桑耶喜（义为善慧智），次传金刚持师洛桑仁卓（义为善慧明解），次传善巧成就金刚持大师耶喜伯觉（义为智富德）。时至今日，辗转流传，盛兴不衰。
　　又由一切智法王宗喀巴大师次第承传诸师：为至尊协饶生根、杜纳巴•伯敦桑波、大密师更敦迫（义为僧增）、大密师扎喜帕（义为吉祥圣）、大密师桑珠嘉措（义为如意成海）、大密师准珠帕（义为精进圣）、大密师多杰桑波（义为金刚贤）、大密师桑杰嘉措（义为佛海）、大密师根却嘉措（义为三宝海）、大密师根却雅迫（义为三宝增盛）、汤萨巴•欧珠嘉措（义为成就海）、成就自在师邓约克珠（义为不空善成）、至尊昂旺绛巴大师（义为语自在慈氏）、雍增•益西坚赞大师等。
　　又由圣龙树次第承传所出诸师，为阿阇黎阿雅德瓦、妥比多杰（义为学习金刚）、大成就师纳波觉巴、喇嘛真季须金（义为云中力师）、仁波切廓（义为廓大宝师）、芒热瓦•生根坚赞（义为师子幢）、垛•耶喜生根（义为慧师子）、垛•阿雅德瓦、伦察•利玛江、达巴•仁清扎（义为宝称）、土拉瓦•楚称交、汤伯瓦•帕巴交、色顶瓦•迅路峨、一切智却姑峨热、一切智帕巴峨、法王布顿仁清珠、至尊上师索朗坚赞、译师朗喀桑波（义为虚空贤）、无等至尊仁达瓦大师、法王宗喀巴大师、至尊协饶生根、大密师敬巴伯瓦（义为布施吉祥）。由此师所弘传密集讲轨承传诸次第，如一般传诵的师承那样，直至住持密集教主至尊昂旺绛巴大师，继由大师传一切智班禅洛桑伯敦耶喜，复传至尊雍增•益西坚赞大师。
　　密集作为无上密父续之王，得到了宗大师的盛赞，一切父续本尊的修习体系都离不开密集之道。按照无上密理论，此生证得密集五次第中的幻身，即可保证即身成佛，宗喀巴就是依据密集，开显出幻身修证之道，使得大密精髓，完整清晰地呈现出来。